„Great Lakes Holocaust“ ist der erste von zwei Bänden, die sich mit Militäreinsätzen in Zaire – wie der Kongo von 1971 bis 1997 hieß – und der Demokratischen Republik Kongo an der Wende zum 21. Jahrhundert befassen. Dieser Band untersucht die Ereignisse der 1980er und 1990er Jahre in Ruanda und Uganda, die sich schließlich über die Grenzen nach Zaire auswirkten und zu einer der schlimmsten Tragödien führten, die jemals eine afrikanische Region heimgesucht hat. Die Erzählung zeichnet den Aufstieg wichtiger ruandischer, kongolesischer und ugandischer Militär- und Politikerpersönlichkeiten und ihre Verbindungen innerhalb einflussreicher Geschäfts- und Politikkreise innerhalb und außerhalb Afrikas nach. Es untersucht den Aufbau des zairischen Militärs unter der Regierung des Diktators Mobutu Sese Seko in den 1960er und 1970er Jahren und bietet eine detaillierte Untersuchung der Gründe für seinen Beinahe-Zusammenbruch in den frühen 1990er Jahren. Die militärische Aufrüstung Ruandas und Ugandas wird ausführlich besprochen, ebenso wie ihre Planung für Operationen in Zaire und der globale logistische Nachlauf, der insbesondere dem ruandischen Militär, aber auch den meisten seiner Gegner, die Möglichkeit gab, nicht nur Krieg zu führen über ihre Grenzen hinaus, sondern - im Fall Ruandas - in ein Land von der Größe Westeuropas oder der USA östlich des Mississippi einzudringen und es praktisch zu erobern. Das Buch zeichnet außerdem die verdeckten ruandischen Militäraktionen in Zaire nach, die zunächst unter dem Deckmantel eines Aufstands von einer der ethnischen Minderheiten Zaires durchgeführt wurden; wie die zunehmende Ausweitung der ruandischen Operationen in Zaire praktisch durch die Konzentration von Hutu-Flüchtlingen diktiert wurde; und wie sich der Aufstand – angeführt von Laurent-Désiré Kabila, der von wichtigen ruandischen und ugandischen Militärs und Politikern eingesetzt wurde – zu einer Organisation entwickelte, die Autonomie vom militärischen und politischen Diktat Ruandas anstrebte, was wiederum einen direkten Grund für den Zweiten Kongo lieferte Krieg, der von 1998 bis 2003 geführt wurde.